賽默飛2720PCR儀反應(yīng)過(guò)程與細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制相似,但PCR的反應(yīng)體系要簡(jiǎn)單的多,主要包括DNA靶序列、引物、4種單核苷酸dNTP、耐熱DNA聚合酶以及合適的緩沖液體系。
樣品到達(dá)域值水平所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)稱(chēng)為Ct值(限制點(diǎn)的循環(huán)數(shù))。域值應(yīng)設(shè)定在使指數(shù)期的擴(kuò)增效率為zui大,這樣可以獲得準(zhǔn)確,可重復(fù)性的數(shù)據(jù)。如果同時(shí)擴(kuò)增的還有標(biāo)有相應(yīng)濃度的標(biāo)準(zhǔn)品,線性回歸分析將產(chǎn)生一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,可以用來(lái)計(jì)算未知樣品的濃度。
在PCR擴(kuò)增時(shí)加入的引物是利用同位素、熒光素等進(jìn)行標(biāo)記,使用引物和熒光探針同時(shí)與模板特異性結(jié)合擴(kuò)增。擴(kuò)增的結(jié)果通過(guò)熒光信號(hào)采集系統(tǒng)實(shí)時(shí)采集信號(hào)連接輸送到計(jì)算機(jī)分析處理系統(tǒng),得出量化的實(shí)時(shí)結(jié)果輸出。
賽默飛2720PCR儀擴(kuò)增產(chǎn)物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散是怎么回事?
1、降解的陳舊模板擴(kuò)增也易產(chǎn)生涂布。
2、酶量過(guò)高。減少酶量;酶的質(zhì)量差,調(diào)換另一來(lái)源的酶。
3、若為PCR試劑盒則可能:①由于運(yùn)輸儲(chǔ)存不當(dāng)引起試劑盒失效;②試劑盒本身質(zhì)量有問(wèn)題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當(dāng)。
4、退火溫度過(guò)低。
5、引物濃度不夠優(yōu)化。對(duì)引物進(jìn)行梯度稀釋重復(fù)PCR反應(yīng)。
6、循環(huán)次數(shù)過(guò)多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時(shí)間及延伸時(shí)間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。
7、MgCl2濃度過(guò)高??蛇m當(dāng)降低其用量。
8、模板量過(guò)多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,而基因組DNA則應(yīng)<200ng。
9、電泳體系有問(wèn)題:①凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;②凝膠沒(méi)有凝固好;③瓊脂糖質(zhì)量差。
10、dNTP濃度過(guò)高。減少dNTP的濃度。